課程資訊
課程名稱
基因體研究論著選讀
Genomic Study Seminar 
開課學期
107-2 
授課對象
醫學院  生理學研究所  
授課教師
賴亮全 
課號
Physio7017 
課程識別碼
441 M3400 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期二7,8(14:20~16:20) 
上課地點
基醫1003 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。
總人數上限:25人
外系人數限制:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1072Physio7017_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程內容如下:
*Introduction: brief history of genetics
*Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques
-- In-house spotted arrays
-- Prespotted array (inkjet print)
-- Photolithograph
-- Maskless array synthesis
-- BeadChip
-- MicroArray Quality Control (MAQC) Project

*Comparative Gene-Expression Analysis II: PCR-based techniques
-- RT-PCR

*Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques
-- Next generation sequencing

*Genomic approaches to study:
-- Gene expression profiling
-- Single nucleotide polymorphism (SNP), copy number variation (CNV), loss of heterozygosity (LOH)
-- DNA-protein interaction
-- Epigenomic: DNA Methylation
-- Epigenomic: noncoding RNA
-- Metagenomics
-- Carcinogenesis and treatment 

課程目標
本課程主旨在透過期刊論文的研讀以及討論,使同學瞭解基因體技術在生物學上的應用及最新發展趨勢。 
課程要求
不遲到早退, 積極參與課堂間的報告與討論 
Office Hours
另約時間 
參考書目
無 
指定閱讀
無 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中考 
40% 
 
2. 
期末口頭報告 
20% 
 
3. 
期末書面報告 
20% 
 
4. 
作業與出席狀況 
20% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/19  Introduction: brief history of genetics/Human Genome Project <b>
課程影音網址: http://llai.cm.ntu.edu.tw/media/499 
第2週
2/26  Break: Keystone conference 
第3週
3/05  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques
<b>課程影音網址: https://llai.cm.ntu.edu.tw/media/508 
第4週
3/12  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第5週
3/19  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第6週
3/26  Comparative Gene-Expression Analysis II/III: /PCR-based techniques/Sequence-based techniques 
第7週
4/02  Spring break 
第8週
4/09  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques 
第9週
4/16  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques 
第10週
4/23  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques/ Mid-term Examination 
第11週
4/30  Genomic approaches to study gene expression 
第12週
5/07  Genomic approaches to study chromosomal aberration 
第13週
5/14  Genomic approaches to study epigenetic regulation: DNA methylation 
第14週
5/21  Genomic approaches to study epigenetic regulation: non-coding RNA 
第15週
5/28  Genomic approaches to study DNA-protein interaction 
第16週
6/04  Genomic approaches to study metagenomics / carcinogenesis and treatment 
第17週
6/11  Final Project Presentation